新冠病毒基因自动化鉴定云平台VIC

新冠病毒基因自动化分析、快速鉴定。

7.6.2解决方案及特色

VIC 平台实现了从病毒组基因组测序到基因组拼接与鉴定的“一键式”自动化服务，极大简化了操作流程。各医院只需上传病例原始数据 至 VIC 平 台 （ http://www.biosino.org/vic/ 和http://hvic.biosino.org/），即可触发病毒基因分析流程，并获得该病例的全基因组分析结果。VIC 得到华为云容器平台强大计算能力的支持，可提供高通量多样本并行云端分析能力。分析结果不仅能为全面分析患者的呼吸道病毒组、研究其致病因子提供支撑，亦可助力临床诊断，为采用相应的治疗措施提供参考，同时还可监测病毒变异趋势，便于提前做出应对措施。

图 7-2 病毒鉴定的技术处理流程

7.6.3应用与效果

2 月 10 日，中国科学院上海营养与健康研究所、中国科学院上海巴斯德研究所共同开发，华为提供云计算技术支撑的病毒基因组自动化鉴定云平台（Virus Identification Cloud， VIC）在华为云正式上线。

该平台直接对接人体样本的 RNA 二代测序原始数据，具有对数据全自动质量控制、拼接和病毒组成分析等功能，实现了快速检测样本中可能存在的包括新冠病毒在内的各种病毒，并在线分析其相对载量。

7.6.4产学研结合情况及效果

VIC 由中国科学院上海巴斯德研究所大数据平台设计，由中国科学院上海营养与健康研究所生物医学大数据中心开发、运维并提供技术支撑，由华为云基因容器提供云服务技术支撑。

VIC 平台只作为一个计算平台，所有的数据权利属于数据提供方， 平台不使用用户数据去发表任何科研论文。疫情期间，VIC 面向科研用户免费开放。

目前，上海市公共卫生临床中心，上海交通大学医学院附属瑞金医院、中国科学院广州生物医药与健康研究院作为平台的首批用户， 已在 VIC 上完成了批量新冠肺炎患者样本的基因组原始测序数据分析。